MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 plasmid pADEG01

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013386	AAG	2	6	9	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013386	A	7	7	40	46	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013386	C	6	6	65	70	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_013386	TCCC	2	8	3458	3465	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_013386	GCTA	2	8	3515	3522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013386	CTTC	2	8	3537	3544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013386	CCA	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013386	T	7	7	3665	3671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013386	TCC	2	6	5980	5985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_013386	GTT	2	6	6028	6033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013386	GGT	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013386	C	6	6	6130	6135	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_013386	T	6	6	6187	6192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013386	CCCG	2	8	6894	6901	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_013386	A	6	6	7918	7923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013386	CCG	3	9	9121	9129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013386	TCG	2	6	9130	9135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013386	GTC	2	6	9141	9146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013386	CGT	2	6	9149	9154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013386	GCTGTC	2	12	9162	9173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013386	TGT	2	6	9185	9190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013386	CTC	2	6	9490	9495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013386	CGG	2	6	9517	9522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013386	CGAAG	2	10	9526	9535	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013386	GC	3	6	9545	9550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013386	GCC	2	6	9560	9565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_013386	GCC	2	6	9574	9579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013386	GAG	2	6	9593	9598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013386	GAG	2	6	9606	9611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013386	TCC	2	6	9647	9652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013386	GAAA	2	8	9661	9668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013386	CCG	2	6	12565	12570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013386	GCC	2	6	12586	12591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013386	GCG	2	6	12629	12634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013386	GCC	2	6	12681	12686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013386	CGG	2	6	12756	12761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013386	GAA	2	6	12855	12860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013386	CAAAGC	2	12	12895	12906	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013386	A	7	7	13256	13262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013386	GCC	2	6	13267	13272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_013386	CAC	2	6	14183	14188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013386	AGG	2	6	14269	14274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013386	A	7	7	14278	14284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013386	CGC	2	6	14416	14421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013386	CCCT	2	8	14438	14445	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_013386	AAC	2	6	14498	14503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013386	CGTC	2	8	14509	14516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013386	TGC	2	6	14541	14546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013386	ACC	2	6	14556	14561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013386	TTC	2	6	14606	14611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013386	TCTT	2	8	14635	14642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013386	GGC	2	6	14653	14658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013386	CGC	2	6	14811	14816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_013386	GCG	2	6	14823	14828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013386	CA	3	6	14890	14895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013386	G	6	6	15012	15017	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013386	AT	3	6	15018	15023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013386	CAG	2	6	15075	15080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013386	CAG	2	6	15355	15360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013386	AAG	2	6	15378	15383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013386	AAAG	2	8	15401	15408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013386	TCA	3	9	15446	15454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013386	T	7	7	15489	15495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013386	CCCA	2	8	15500	15507	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_013386	CGG	2	6	15520	15525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013386	CCA	2	6	15532	15537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013386	CGG	2	6	16932	16937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013386	GGCC	2	8	16952	16959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013386	GGT	2	6	16964	16969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013386	CCG	2	6	17020	17025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013386	AAC	2	6	17909	17914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013386	CGG	2	6	17939	17944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013386	GCG	2	6	17964	17969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013386	CA	3	6	17970	17975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013386	CGG	2	6	18142	18147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013386	CG	3	6	18165	18170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013386	CCCT	2	8	20598	20605	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_013386	CAG	2	6	20609	20614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013386	TAGG	2	8	20632	20639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013386	TAGG	2	8	20660	20667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013386	GGT	2	6	20781	20786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013386	AC	3	6	20810	20815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013386	AGA	2	6	20868	20873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013386	TTC	2	6	20913	20918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013386	CTA	3	9	20929	20937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013386	GGC	2	6	20961	20966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013386	CT	3	6	20993	20998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013386	CGT	2	6	21010	21015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013386	GGC	2	6	21016	21021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013386	CCG	2	6	21034	21039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013386	GGCC	2	8	21055	21062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013386	CT	3	6	21071	21076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013386	TAG	2	6	21125	21130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013386	AAAG	2	8	21289	21296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013386	TCA	2	6	21337	21342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013386	T	6	6	21365	21370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013386	ACCT	2	8	21394	21401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013386	CGG	2	6	22739	22744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013386	GGCC	2	8	22759	22766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013386	GGT	2	6	22771	22776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013386	CCG	2	6	22827	22832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_013386	CT	3	6	22897	22902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013386	GCTC	2	8	22937	22944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013386	CGG	2	6	23301	23306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013386	CGTC	2	8	23323	23330	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013386	GAC	2	6	23354	23359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013386	ACC	2	6	23395	23400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_013386	ATC	2	6	23423	23428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013386	CG	4	8	23438	23445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013386	AGC	2	6	23450	23455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013386	TCC	2	6	23553	23558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013386	CG	3	6	23593	23598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013386	T	6	6	23659	23664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013386	TG	3	6	24180	24185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013386	GCA	2	6	24477	24482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013386	CAAAA	2	10	24488	24497	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013386	CGG	2	6	24547	24552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013386	A	6	6	24581	24586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013386	AGA	2	6	24610	24615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013386	TTC	2	6	26936	26941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013386	CT	3	6	26949	26954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013386	ACCC	2	8	27656	27663	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_013386	ACATT	2	10	27678	27687	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_013386	CGG	2	6	27799	27804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013386	CCTG	2	8	27813	27820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.